COI条形码在我国市场常见鱼类品种鉴定中的应用开题报告
2020-08-04 09:08
1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)
文献综述 1.1水产品概述 改革开放以来,我国渔业生产发展迅速,水产品生产保持快速增长。
2016年,我国水产品总产量达到6901.25万吨,比1978年增长了14.8倍[1]。
目前,我国已经成为世界上最大的水产品生产国家,2016年我国水产品总产量在世界水产品总产量中的占比达到61.7% [2]。
2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案
1研究的内容 (1)市场采集的共140份硬骨鱼类的dna提取 (2)通用引物扩增coi条形码 (3)序列分析与物种鉴定 2.2主要的研究手段 (1)dna的提取(图1); 图1 dna提取方法 (2)coi条形码的扩增(表1); 表1 coi条形码通用引物序列 primer name primer sequence (5′-3′) barcode length (bp) fishco1lbc cacgacgttgtaaaacgactcaacyaatcayaaagatatyggcac 655bp fishco1hbc ggataacaatttcacacaggacttcygggtgrccraaraatca m13f-29 cacgacgttgtaaaacgac na m13r ggataacaatttcacacagg (3)扩增反应参数(表2) 表2 扩增反应参数 initial denaturation denaturation annealing extension final extension number of cycles 94℃ 2min 94℃ 30s 55℃ 40s 72℃ 60s 72℃ 10min 35 (4)序列进行分析 将pcr产物送至测序公司(金斯瑞生物科技,中国)进行测序。
每个目标片段测序两次,进行两个方向相反方向的直接测序,且允许产生四个高质量的互补序列。
使用可获得的bioedit v7.2.5软件(ibis biosciences,carlsbad,ca,usa)对测序数据进行比对,使用mega7.0.14软件绘制进化树。
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